南北卷来自明初的南北案，当时主考官刘三吾主持春试，所取五十一人，各个都是南方人，而北方一个没取。
于是落第北方举人，联名控诉说主考官搞‘地域歧视’，朱元璋听了大怒，将刘三吾下狱，下令彻察此事，但彻察结果，刘三吾并没有徇私舞弊，确确实实在北方士子的落卷里，都存在着文法不通的弊病。
朱元璋不信这结果，认为是官员袒护，当下再度主持会试，又招考了六十三人，各个都取北方人。
从此大明科举定下南北卷的制度，以地域分配名额取士。
以取进士一百名为比率，南卷的士子可占五十五名，北卷的士子占三十五名，中卷的士子占十名。
这一次制度从此定下，题外话说一句，元朝会试也是大概如此，只是按一百人中，蒙古，色目，汉人，南人各取二十五人。
当年明初重臣三杨之一杨士奇，曾与明仁宗有过这样一段对话。
杨士奇说，科举当兼取南北之士，仁宗说，可北人学问，远不如南人。杨士奇说，长才大器俱出北方，南人虽有才华，多轻浮。
仁宗问那怎么办？
杨士奇说缄其姓名，分南北取士，南北人才，皆入彀也。
仁宗道，好办法，以往北人无人入榜，故而懒惰成风，今南北取士，北方士子应奋起。
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