在司法领域，则主要是对案件审判进行监督。当然也有纠察之权，对小官员的轻微处分可以自行决断。
大理寺主要职能是案件复核，确保司法公正，防止冤假错案。
大理寺审核通过的案件，刑部、都察院才可以具狱发遣。大理寺如果认为案件有问题，可以抗诉，最终一般会上奏圣裁。
可见都察院、大理寺虽然都有监督审核案件的职能，但都察院更侧重管人，主要是看断案官是否徇私舞弊，大理寺更侧重业务，主要是看案件判决是否有错。
从地位上看，大理寺相对较低，刑部、都察院主官都是七卿之一，大理寺没那么重要。
从业务上看，刑部比较窝囊，干最脏最累的活，还要受都察院、大理寺双重监督。
从哪个角度来说，都察院都是最强大的，只可惜都察院通常是各顾各，各做各的事情，没有刑部和大理寺那么完整形成一个整体。
所以，三司一直以来都处于一个平衡状态，分银子也要看具体案子，这条案子上的官员，不管是刑部，还是都察院和大理寺，相关官员都能分一杯羹，最大的，掌权的官员能分一杯羹。
韦宝这么做，显然是要拿走最大的主官的权力，王纪自然不干。
都察院的都御史和大理寺卿也不想按照韦宝这一套来，只是暂时被司礼监压住了，魏忠贤不将驳回韦宝在都察院和大理寺自行改造人事的奏本打回来，他们就没有办法针对韦宝。
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